Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC42.54■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC42.51■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC42.49■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC42.47■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC42.45■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC42.44■■■■■ 4.39
RSF1Q96T23 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
RSF1Q96T23 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
RSF1Q96T23 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
RSF1Q96T23 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
RSF1Q96T23 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
RSF1Q96T23 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
RSF1Q96T23 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
RSF1Q96T23 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
RSF1Q96T23 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
RSF1Q96T23 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
RSF1Q96T23 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
RSF1Q96T23 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
RSF1Q96T23 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
RSF1Q96T23 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
RSF1Q96T23 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
RSF1Q96T23 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC42.39■■■■■ 4.38
RSF1Q96T23 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
RSF1Q96T23 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
RSF1Q96T23 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
RSF1Q96T23 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
RSF1Q96T23 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.36
RSF1Q96T23 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
RSF1Q96T23 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
RSF1Q96T23 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
RSF1Q96T23 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
RSF1Q96T23 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
RSF1Q96T23 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms