Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms