Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK15Q96Q40 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK15Q96Q40 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms