Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC9Q96Q05 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms