Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms