Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT1

RNF145, RING finger protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF145Q96MT1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF145Q96MT1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms