Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSMCE3Q96MG7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NSMCE3Q96MG7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms