Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI5

CNOT6L, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6LQ96LI5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNOT6LQ96LI5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNOT6LQ96LI5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNOT6LQ96LI5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNOT6LQ96LI5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNOT6LQ96LI5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CNOT6LQ96LI5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNOT6LQ96LI5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT6LQ96LI5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT6LQ96LI5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT6LQ96LI5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT6LQ96LI5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT6LQ96LI5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CNOT6LQ96LI5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNOT6LQ96LI5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT6LQ96LI5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms