Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VCPIP1Q96JH7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms