Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IMP4Q96G21 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms