Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTERF3Q96E29 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms