Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RUNDC1Q96C34 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RUNDC1Q96C34 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms