Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYTL4Q96C24 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYTL4Q96C24 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYTL4Q96C24 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYTL4Q96C24 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SYTL4Q96C24 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SYTL4Q96C24 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SYTL4Q96C24 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SYTL4Q96C24 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms