Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT1

C3orf49, Putative uncharacterized protein C3orf49, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf49Q96BT1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf49Q96BT1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C3orf49Q96BT1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C3orf49Q96BT1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf49Q96BT1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf49Q96BT1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf49Q96BT1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf49Q96BT1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf49Q96BT1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf49Q96BT1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf49Q96BT1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf49Q96BT1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf49Q96BT1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf49Q96BT1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms