Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC74AQ96AQ1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC74AQ96AQ1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC74AQ96AQ1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC74AQ96AQ1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC74AQ96AQ1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC74AQ96AQ1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC74AQ96AQ1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC74AQ96AQ1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC74AQ96AQ1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC74AQ96AQ1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC74AQ96AQ1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC74AQ96AQ1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC74AQ96AQ1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC74AQ96AQ1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC74AQ96AQ1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC74AQ96AQ1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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