Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC35C1Q96A29 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC35C1Q96A29 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms