Protein–RNA interactions for Protein: Q969S0

SLC35B4, UDP-xylose and UDP-N-acetylglucosamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35B4Q969S0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC35B4Q969S0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC35B4Q969S0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC35B4Q969S0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC35B4Q969S0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35B4Q969S0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35B4Q969S0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35B4Q969S0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35B4Q969S0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35B4Q969S0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35B4Q969S0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35B4Q969S0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35B4Q969S0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35B4Q969S0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC35B4Q969S0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC35B4Q969S0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms