Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A3Q93084 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms