Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXT2Q93063 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXT2Q93063 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXT2Q93063 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXT2Q93063 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXT2Q93063 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXT2Q93063 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXT2Q93063 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EXT2Q93063 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXT2Q93063 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXT2Q93063 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
EXT2Q93063 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EXT2Q93063 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EXT2Q93063 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EXT2Q93063 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EXT2Q93063 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms