Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRF1Q92994 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BRF1Q92994 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRF1Q92994 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRF1Q92994 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRF1Q92994 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRF1Q92994 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRF1Q92994 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRF1Q92994 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRF1Q92994 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRF1Q92994 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRF1Q92994 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRF1Q92994 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRF1Q92994 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRF1Q92994 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRF1Q92994 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRF1Q92994 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRF1Q92994 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
BRF1Q92994 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRF1Q92994 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRF1Q92994 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
BRF1Q92994 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRF1Q92994 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BRF1Q92994 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BRF1Q92994 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRF1Q92994 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRF1Q92994 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRF1Q92994 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRF1Q92994 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BRF1Q92994 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRF1Q92994 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BRF1Q92994 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BRF1Q92994 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRF1Q92994 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BRF1Q92994 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRF1Q92994 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRF1Q92994 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BRF1Q92994 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BRF1Q92994 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRF1Q92994 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRF1Q92994 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRF1Q92994 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRF1Q92994 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
BRF1Q92994 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRF1Q92994 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRF1Q92994 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BRF1Q92994 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRF1Q92994 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BRF1Q92994 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRF1Q92994 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRF1Q92994 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BRF1Q92994 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BRF1Q92994 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
BRF1Q92994 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRF1Q92994 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRF1Q92994 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BRF1Q92994 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BRF1Q92994 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BRF1Q92994 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms