Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RAD50Q92878 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RAD50Q92878 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms