Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM9SF4Q92544 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF4Q92544 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF4Q92544 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms