Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBLCP1Q8WVY7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms