Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC12Q8WVT3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC12Q8WVT3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC12Q8WVT3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms