Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVR3

C7orf43, Uncharacterized protein C7orf43, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43Q8WVR3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
C7orf43Q8WVR3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C7orf43Q8WVR3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C7orf43Q8WVR3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C7orf43Q8WVR3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C7orf43Q8WVR3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C7orf43Q8WVR3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C7orf43Q8WVR3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C7orf43Q8WVR3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C7orf43Q8WVR3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C7orf43Q8WVR3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C7orf43Q8WVR3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C7orf43Q8WVR3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C7orf43Q8WVR3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C7orf43Q8WVR3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C7orf43Q8WVR3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C7orf43Q8WVR3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C7orf43Q8WVR3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
C7orf43Q8WVR3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
C7orf43Q8WVR3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1666.4 ms