Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRN4Q8WUT4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN4Q8WUT4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms