Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNDC9Q8TBE3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNDC9Q8TBE3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FNDC9Q8TBE3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms