Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf43Q8TAL5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms