Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HELBQ8NG08 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HELBQ8NG08 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms