Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP43Q8NFH3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms