Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
COLGALT1Q8NBJ5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COLGALT1Q8NBJ5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms