Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CNBD1Q8NA66 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CNBD1Q8NA66 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms