Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M0

OTUD6B, OTU domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6BQ8N6M0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD6BQ8N6M0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms