Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCML4Q8N228 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCML4Q8N228 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCML4Q8N228 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCML4Q8N228 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCML4Q8N228 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCML4Q8N228 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCML4Q8N228 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCML4Q8N228 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms