Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMNTD2Q8IXW0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms