Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM48Q8IWZ4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM48Q8IWZ4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms