Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
APLFQ8IW19 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms