Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC22A9Q8IVM8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms