Protein–RNA interactions for Protein: Q86WK6

AMIGO1, Amphoterin-induced protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1Q86WK6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMIGO1Q86WK6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1Q86WK6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1Q86WK6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1Q86WK6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1Q86WK6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1Q86WK6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1Q86WK6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMIGO1Q86WK6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMIGO1Q86WK6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms