Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPAINQ86UA6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms