Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6I5

SPATA12, Spermatogenesis-associated protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA12Q7Z6I5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPATA12Q7Z6I5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPATA12Q7Z6I5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms