Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRGAP1Q7Z6B7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRGAP1Q7Z6B7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRGAP1Q7Z6B7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRGAP1Q7Z6B7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRGAP1Q7Z6B7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRGAP1Q7Z6B7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRGAP1Q7Z6B7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRGAP1Q7Z6B7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRGAP1Q7Z6B7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRGAP1Q7Z6B7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRGAP1Q7Z6B7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRGAP1Q7Z6B7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRGAP1Q7Z6B7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRGAP1Q7Z6B7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms