Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4K8

TRIM46, Tripartite motif-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM46Q7Z4K8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM46Q7Z4K8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM46Q7Z4K8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms