Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3T8

ZFYVE16, Zinc finger FYVE domain-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE16Q7Z3T8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ZFYVE16Q7Z3T8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ZFYVE16Q7Z3T8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ZFYVE16Q7Z3T8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ZFYVE16Q7Z3T8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
ZFYVE16Q7Z3T8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
ZFYVE16Q7Z3T8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ZFYVE16Q7Z3T8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ZFYVE16Q7Z3T8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ZFYVE16Q7Z3T8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
ZFYVE16Q7Z3T8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
ZFYVE16Q7Z3T8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ZFYVE16Q7Z3T8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ZFYVE16Q7Z3T8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ZFYVE16Q7Z3T8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ZFYVE16Q7Z3T8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ZFYVE16Q7Z3T8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
ZFYVE16Q7Z3T8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
ZFYVE16Q7Z3T8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
ZFYVE16Q7Z3T8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ZFYVE16Q7Z3T8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ZFYVE16Q7Z3T8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms