Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF550Q7Z398 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms