Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RUFY3Q7L099 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms