Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHSY3Q70JA7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHSY3Q70JA7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms