Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms