Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC129Q6ZRS4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC129Q6ZRS4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms