Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP6Q6ZN66 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP6Q6ZN66 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms